Badania wykazały, że istnieją znaczne różnice w składzie mikroflory u dzieci urodzonych w sposób naturalny, a tych które przyszły na świat przez cesarskie cięcie. U dzieci urodzonych naturalnie obecne są drobnoustroje odzwierciedlające florę pochwy matki, m.in. Lactobacillus.
Maluszki urodzone przez cesarskie cięcie mają mniej rozwinięty mikrobiom. Jest on zasiedlany z opóźnieniem i często mikroflorą środowiska szpitalnego. Noworodek jest pozbawiony naturalnego kontaktu z drogami rodnymi. Otoczenie w sali operacyjnej (sprzęt, środki dezynfekujące, rękawiczki) sprzyja opóźnieniu prawidłowej kolonizacji jelit. W mikrobiocie znajdziemy mniej potrzebnych bakterii, takich jak Bifidobacterium, czy Lactobacillus, a więcej bakterii chorobotwórczych, jak na przykład Escherichia coli. Zaburzony skład i funkcje mikroflory jelitowej u noworodka mogą skutkować wieloma problemami w późniejszym wieku.
Problem zaburzeń może dotykać też wcześniaków. Przedwczesny poród często wiąże się z licznymi interwencjami, m.in. kortykosteroidoterapią lub antybiotykoterapią. Wcześniak często jest poddawany jest wielu procedurom medycznym co dodatkowo nie ułatwia właściwej kolonizacji mikrobiomu.
Jak wspierać noworodka urodzonego przedwcześnie lub przy pomocy cesarskiego cięcia? Mikroflorę jelitową można po prostu uzupełniać stosując specjalistyczne preparaty.